尼木县居雅鲁藏布江中游北岸。山峦起伏，河谷纵横。地形西高东低，平均海拔4000米以上，境内最高点穷母岗峰，海拔7048米，最低点为玛曲河汇入雅鲁藏布江处，海拔为3700米。

山峦起伏，沟谷纵横。地形西高东低，平均海拔4000米以上，境内最高穷母岗峰，海拔为7048米，最低点为玛曲汇入雅鲁藏布江处，海拔3700米。

尼木县属高原温带半干旱季风气候区，四季分明，夏季雨水集中，辐射强，年日照时数2947.2小时。年无霜期100天左右。年降水量324.2毫米。